Susunan Organisasi Perangkat Daerah (OPD) Pemerintah Kabupaten Mesuji berdasarkan Peraturan Daerah (Perda) Kabupaten Mesuji Nomor 5 Tahun 2016 tentang Pembentukan dan Susunan Perangkat Daerah Kabupaten Mesuji

1. Sekretariat Daerah Kabupaten Mesuji
2. Sekretariat Dewan Perwakilan Rakyat Daerah Kabupaten Mesuji
3. Inspektorat Daerah Kabupaten Mesuji
4. Dinas Kependudukan dan Pencatatan Sipil Kabupaten Mesuji
5. Dinas Pengendalian Penduduk, Keluarga Berencana, Pemberdayaan Perempuan, dan Perlindungan Anak Kabupaten Mesuji
6. Dinas Pendidikan dan Kebudayaan Kabupaten Mesuji
7. Dinas Kesehatan Kabupaten Mesuji
8. Dinas Pertanian Kabupaten Mesuji
9. Dinas Perhubungan, Komunikasi, dan Informatika Kabupaten Mesuji
10. Dinas Pekerjaan Umum dan Penataan Ruang Kabupaten Mesuji
11. Dinas Kelautan dan Perikanan Kabupaten Mesuji
12. Dinas Koperasi UKM, Perindustrian, dan Perdagangan Kabupaten Mesuji
13. Dinas Pemuda, Olahraga, dan Pariwisata Kabupaten Mesuji
14. Dinas Lingkungan Hidup Kabupaten Mesuji
15. Dinas Ketahanan Pangan Kabupaten Mesuji
16. Dinas Pemberdayaan Masyarakat dan Desa Kabupaten Mesuji
17. Dinas Penanaman Modal dan Pelayanan Terpadu Satu Pintu Kabupaten Mesuji
18. Dinas Sosial Kabupaten Mesuji
19. Dinas Tenaga Kerja dan Transmigrasi Kabupaten Mesuji
20. Dinas Perumahan dan Kawasan Pemukiman Kabupaten Mesuji
21. Dinas Perpustakaan dan Arsip Kabupaten Mesuji
22. Satuan Polisi Pamong Praja Kabupaten Mesuji
23. Badan Pendapatan, Pengelolaan Keuangan, dan Aset Daerah Kabupaten Mesuji
24. Badan Perencanaan Pembangunan Daerah Kabupaten Mesuji
25. Badan Kepegawaian dan Diklat Daerah Kabupaten Mesuji
26. Kecamatan Simpang Pematang
27. Kecamatan Mesuji
28. Kecamatan Mesuji Timur
29. Kecamatan Panca Jaya
30. Kecamatan Rawa Jitu Utara
31. Kecamatan Tanjung Raya
32. Kecamatan Way Serdang
33. Badan Kesatuan Bangsa dan Politik Kabupaten Mesuji
34. Badan Penanggulangan Bencana Daerah Kabupaten Mesuji
35. Sekretariat Dewan Pengurus Korpri